新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来， 人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。 具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员， 与研究所员齐心协力，面对强大的敌人！ 究竟“漆黑新干线”的目的是……。孩子们能否守护日本的未来……。 变身！SHINKALION！
东山奈央/小西克幸/土岐隼一/内田雄马/加隈亚衣/田丸笃志/中惠光城/井上雄贵/上田丽奈/江口拓也/关智一/仪武祐子/高桥伸也/石见舞菜香/洲崎绫/悠木碧/石川界人/寺岛拓笃/平川大辅/柿原彻也/金子彩花/增元拓也/水桥香织/日野聪/井上和彦/铃木实里